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Arabidopsis F-BOX STRESS INDUCED 4 is required to repress excessive divisions in stomatal development
期刊论文
JOURNAL OF INTEGRATIVE PLANT BIOLOGY, 2022, 卷号: 64, 期号: 1, 页码: 56-72
作者:
Li, Yi
;
Xue, Shan
;
He, Qixiumei
;
Wang, Junxue
;
Zhu, Lingling
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提交时间：2024/03/07
cell division
cell cycle
F-BOX
stomatal development
ubiquitination
Molecular simulation studies of the interactions between the human/ pangolin/cat/bat ACE2 and the receptor binding domain of the SARS-CoV-2 spike protein
期刊论文
BIOCHIMIE, 2021, 卷号: 187, 页码: 1-13
作者:
Ma, Shaojie
;
Li, Hui
;
Yang, Jun
;
Yu, Kunqian
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浏览/下载：68/0
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提交时间：2021/08/17
SARS-CoV-2
ACE2
Molecular simulation
Binding energy
Animal hosts
COMTOP: Protein Residue-Residue Contact Prediction through Mixed Integer Linear Optimization
期刊论文
MEMBRANES, 2021, 卷号: 11, 期号: 7, 页码: 21
作者:
Reza, Md Selim
;
Zhang, Huiling
;
Hossain, Md Tofazzal
;
Jin, Langxi
;
Feng, Shengzhong
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浏览/下载：16/0
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提交时间：2021/12/01
protein residue-residue contact
contact prediction
mixed integer linear programming
machine learning
protein sequence
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 13
作者:
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Ju, Fusong
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
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浏览/下载：41/0
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提交时间：2021/12/01
Protein structure
Secondary structure elements
Inter-SSE contacts
ISSEC: inferring contacts among protein secondary structure elements using deep object detection
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2020, 卷号: 21, 期号: 1, 页码: 503
作者:
Zhang, Qi
;
Zhu, Jianwei
;
Ju, Fusong
;
Kong, Lupeng
;
Sun, Shiwei
收藏
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浏览/下载：49/0
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提交时间：2021/09/27
HELIX-HELIX INTERACTIONS
INVERSE COVARIANCE ESTIMATION
RESIDUE CONTACTS
BETA-SHEETS
PREDICTION
MEMBRANE
Predicting protein inter-residue contacts using composite likelihood maximization and deep learning
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 11
作者:
Zhang, Haicang
;
Zhang, Qi
;
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Gao, Yujuan
收藏
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浏览/下载：50/0
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提交时间：2020/12/10
Residue-residue contacts prediction
Deep learning
Markov random fields
Composite likelihood maximization
Predicting protein inter-residue contacts using composite likelihood maximization and deep learning
期刊论文
BMC BIOINFORMATICS, 2019, 卷号: 20, 期号: 1, 页码: 537
作者:
Zhang, Haicang
;
Zhang, Qi
;
Ju, Fusong
;
Zhu, Jianwei
;
Gao, Yujuan
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浏览/下载：4/0
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提交时间：2020/06/16
COUPLING ANALYSIS
SEQUENCE
EVOLUTIONARY
INFORMATION
NETWORKS
RANK
Template-based and free modeling of I-TASSER and QUARK pipelines using predicted contact maps in CASP12
期刊论文
PROTEINS-STRUCTURE FUNCTION AND BIOINFORMATICS, 2018, 卷号: 86, 页码: 136-151
作者:
Wang, YT
;
Zhang, CX
;
Mortuza, SM
;
He, BJ
;
Zhang, Y
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浏览/下载：88/0
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提交时间：2018/12/27
PROTEIN-STRUCTURE PREDICTION
RESIDUE CONTACTS
SEQUENCE
ALIGNMENTS
ACCURACY
NETWORKS
ROLL
Improving protein fold recognition by extracting fold-specific features from predicted residue-residue contacts
期刊论文
BIOINFORMATICS, 2017, 卷号: 33, 期号: 23, 页码: 3749-3757
作者:
Zhu, Jianwei
;
Zhang, Haicang
;
Li, Shuai Cheng
;
Wang, Chao
;
Kong, Lupeng
收藏
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浏览/下载：25/0
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提交时间：2019/12/10
RRCRank: a fusion method using rank strategy for residue-residue contact prediction
期刊论文
BMC Bioinformatics, 2017, 卷号: 18, 期号: 1
作者:
Jing,Xiaoyang
;
Dong,Qiwen
;
Lu,Ruqian
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浏览/下载：20/0
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提交时间：2018/07/30
Protein residue-residue contact prediction
Learning-to-rank
Fusion method
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