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科研机构
西安交通大学 [8]
内容类型
期刊论文 [8]
发表日期
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专题：西安交通大学
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SVSR: a Program to Simulate Structural Variations and Generate Sequencing Reads for Multiple Platforms
期刊论文
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018
作者:
Yuan, Xiguo
;
Gao, Meihong
;
Bai, Jun
;
Duan, Junbo
收藏
|
浏览/下载：9/0
|
提交时间：2019/11/19
Benchmark testing
Biological cells
Copy number variations
Genomics
Indels
Inversions and translocations
Sequence reads
Sequential analysis
SNPs
Structural variations
CONDEL: Detecting Copy Number Variation and Genotyping Deletion Zygosity from Single Tumor Samples using Sequence Data
期刊论文
IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics, 2018
作者:
Yuan, Xiguo
;
Bai, Jun
;
Zhang, Junying
;
Yang, Liying
;
Duan, Junbo
收藏
|
浏览/下载：4/0
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提交时间：2019/11/26
Bayes method
Bayesian inference
Cancer
Copy number variations
deletion zygosity
Drugs
Genomics
NGS data
Statistical significance test
A Sparse Model Based Detection of Copy Number Variations From Exome Sequencing Data
期刊论文
IEEE TRANSACTIONS ON BIOMEDICAL ENGINEERING, 2016, 卷号: 63, 期号: [db:dc_citation_issue], 页码: 496-505
作者:
Duan, Junbo
;
Wan, Mingxi
;
Deng, Hong-Wen
;
Wang, Yu-Ping
收藏
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浏览/下载：12/0
|
提交时间：2019/12/02
matrix approximation
sparse modeling
exome sequencing
Copy number variation (CNV)
iteratively reweighted least squares (IRLS)
CPAS: A trans-omics pathway analysis tool for jointly analyzing DNA copy number variations and mRNA expression profiles data
期刊论文
JOURNAL OF BIOMEDICAL INFORMATICS, 2015, 卷号: 53, 期号: [db:dc_citation_issue], 页码: 363-366
作者:
Zhang, Feng
;
Xiao, Xiao
;
Hao, Jingcan
;
Wang, Sen
;
Wen, Yan
收藏
|
浏览/下载：3/0
|
提交时间：2019/12/02
Pathway analysis
CPAS
Gene expression
Copy number variations
Population clustering based on copy number variations detected from next generation sequencing data
期刊论文
JOURNAL OF BIOINFORMATICS AND COMPUTATIONAL BIOLOGY, 2014, 卷号: 12, 期号: [db:dc_citation_issue]
作者:
Duan, Junbo
;
Zhang, Ji-Gang
;
Wan, Mingxi
;
Deng, Hong-Wen
;
Wang, Yu-Ping
收藏
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浏览/下载：3/0
|
提交时间：2019/12/02
non-negative matrix factorization
Next generation sequencing
copy number variations
1000 Genomes Project
Detection of prostate cancer related copy number variations with SNP genotyping array
期刊论文
EUROPEAN REVIEW FOR MEDICAL AND PHARMACOLOGICAL SCIENCES, 2013, 卷号: 17, 期号: [db:dc_citation_issue], 页码: 2916-2922
作者:
Wang, Y.
;
Yao, X.
;
Li, S. -N.
;
Suo, A. -L.
;
Tian, T.
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2019/12/03
CNV
Prostate cancer
Pathway
miRNA
Detection of prostate cancer related copy number variations with SNP genotyping array.
期刊论文
European review for medical and pharmacological sciences, 2013, 卷号: 17, 期号: [db:dc_citation_issue], 页码: 2916-22
作者:
Wang Y
;
Yao X
;
Li S-N
;
Suo A-L
;
Tian T
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2019/12/10
Copy Number Variations at the Prader-Willi Syndrome Region on Chromosome 15 and associations with Obesity in Whites
期刊论文
OBESITY, 2011, 卷号: 19, 期号: [db:dc_citation_issue], 页码: 1229-1234
作者:
Chen, Yuan
;
Liu, Yong-Jun
;
Pei, Yu-Fang
;
Yang, Tie-Lin
;
Deng, Fei-Yan
收藏
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浏览/下载：2/0
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提交时间：2019/12/10
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