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北京大学 [3]
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Mechanism of Phosphorylation-Induced Folding of 4E-BP2 Revealed by Molecular Dynamics Simulations
期刊论文
JOURNAL OF CHEMICAL THEORY AND COMPUTATION, 2017
Zeng, Juan
;
Jiang, Fan
;
Wu, Yun-Doug
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提交时间:2017/12/03
CAP-DEPENDENT TRANSLATION
LINEAR CONSTRAINT SOLVER
FORCE-FIELD
CONFORMATIONAL SWITCH
TRP-CAGE
POSTTRANSLATIONAL MODIFICATIONS
PROTEIN-PHOSPHORYLATION
DISORDERED PROTEIN
DENATURED STATE
HYDROGEN-BONDS
Intrinsically disordered regions stabilize the helical form of the C-terminal domain of RfaH: A molecular dynamics study
期刊论文
BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY, 2016
Xun, Sangni
;
Jiang, Fan
;
Wu, Yun-Dong
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提交时间:2017/12/04
MD simulation
Intrinsic disorder
RfaH
Salt-bridge
Protein
alpha-Helix
TRANSCRIPTION FACTOR
CONFORMATIONAL TRANSFORMATION
BINDING AFFINITIES
ESCHERICHIA-COLI
ALPHA-HELIX
AMINO-ACIDS
PROTEIN
FIELD
SIMULATIONS
ELONGATION
Conserved amphiphilic feature is essential for periplasmic chaperone HdeA to support acid resistance in enteric bacteria
期刊论文
biochemical journal, 2008
Wu, Ye E.
;
Hong, Weizhe
;
Liu, Chong
;
Zhang, Lingqing
;
Chang, Zengyi
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提交时间:2015/11/14
acid stress
chaperone
enteric bacterium
folding
hns-dependent expression A (HdeA)
hydrophobic interaction
INTRINSICALLY UNSTRUCTURED PROTEINS
ESCHERICHIA-COLI
SHIGELLA-FLEXNERI
PH
DENATURATION
DISORDER
RELEASE
ENZYMES
STATES
GENES
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