嗜根寡养单胞菌（Stenotrophomonas rhizophila）JC1重金属抗性及其解毒蛋白生物信息学分析

doi:10.13637/j.issn.1009-6094.2020.0654

	嗜根寡养单胞菌（Stenotrophomonas rhizophila）JC1重金属抗性及其解毒蛋白生物信息学分析
	孙尚琛 2; 陈吉祥 1; 王永刚 3; 陈凯 3; 冷非凡 3
刊名	安全与环境学报
	2021-08-25
卷号	21 期号:04 页码:1788-1796
关键词	环境科学技术基础学科嗜根寡养单胞菌解毒蛋白生物信息学结构功能
DOI	10.13637/j.issn.1009-6094.2020.0654
英文摘要	为研究某些重金属解毒蛋白在微生物抗重金属过程中发挥的作用,从常年受重金属污染的某化工厂附近土壤中分离、驯化得到一株对铅、铜、镉3种金属有较好抗性的嗜根寡养单胞菌(Stenotrophomonas rhizophila) JC1,并对其进行了全基因组测序。通过分析其蛋白家族、代谢通路等,发现蛋白质AHY58868.1、AHY59763.1、AHY58405.1和AHY57635.1与重金属解毒直接相关,故利用分析软件对4种蛋白的生物学性质、结构功能和相互作用等分别进行了分析。生理生化试验结果表明,菌株JC1表面光滑,菌落边缘整齐,为无芽孢的革兰氏阳性菌,Pb2+、Cu2+和Cd2+的去除率最高分别可达76.9%、96.7%和47.7%。生物信息学分析结果表明,AHY58405.1为不稳定的亲水性蛋白,而其余3种为相对较稳定的亲水性蛋白。AHY58868.1和AHY59763.1无信号肽结构,而AHY58405.1和AHY57635.1存在信号肽结构。AHY58868.1和AHY57635.1于细胞内膜发挥作用,AHY59763.1在细胞质内发挥作用,AHY58405.1在周质空间发挥作用。蛋白质结构功能和蛋白间相互作用关系分析表明,AHY58868.1主要参与机体铜离子的转运,对维持细胞内铜平衡起关键作用; AHY59763.1和AHY58405.1主要介导重金属与某些阴离子(—PO43-、—SH、—NH2、—COOH等)基团的络合,尤其是AHY59763.1在微生物体内可为二价重金属的络合提供多个活性位点; AHY57635.1主要参与机体的ABC转运蛋白的转运过程,可介导重金属向胞外的排出。
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内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.lut.edu.cn/handle/2XXMBERH/156150]
专题	生命科学与工程学院石油化工学院
作者单位	1.兰州理工大学石油化工学院;; 2.兰州兰石能源装备工程研究院有限公司;; 3.兰州理工大学生命科学与工程学院
推荐引用方式 GB/T 7714	孙尚琛,陈吉祥,王永刚,等. 嗜根寡养单胞菌（Stenotrophomonas rhizophila）JC1重金属抗性及其解毒蛋白生物信息学分析[J]. 安全与环境学报,2021,21(04):1788-1796.
APA	孙尚琛,陈吉祥,王永刚,陈凯,&冷非凡.(2021).嗜根寡养单胞菌（Stenotrophomonas rhizophila）JC1重金属抗性及其解毒蛋白生物信息学分析.安全与环境学报,21(04),1788-1796.
MLA	孙尚琛,et al."嗜根寡养单胞菌（Stenotrophomonas rhizophila）JC1重金属抗性及其解毒蛋白生物信息学分析".安全与环境学报 21.04(2021):1788-1796.