基于BSA分析定位控制西藏大麦侧小穗发育的基因

doi:10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.03032

CORC > 成都生物研究所 > 中国科学院成都生物研究所 > 食品安全与环境治理领域 > 农业生物技术研究

	基于BSA分析定位控制西藏大麦侧小穗发育的基因
	徐珍媚 1,2; 邓光兵 1; 张海莉 1; 梁俊俊 1; 苏燕 1; 李莉岚 1; 龙海 1; 余懋群 1
刊名	应用与环境生物学报
	2018
卷号	24 期号:6 页码:1350-1358
关键词	西藏大麦棱数性状集群分离法(BSA) 基因定位
ISSN号	1006-687X
DOI	10.19675/j.cnki.1006-687x.2018.03032
其他题名	Mapping loci that control lateral spike development in Tibetan barley by bulked segregant analysis (BSA)
产权排序	1
文献子类	Article
英文摘要	大麦侧小穗结实与否导致了二棱/六棱性状的分化,从而显著影响其籽粒产量,因此大麦二棱到六棱的变化具有显著驯化特征.青藏高原野生和栽培大麦资源丰富,被认为是栽培大麦的驯化和遗传多样性中心之一.为进一步了解大麦棱数调控的遗传基础以及西藏栽培大麦驯化的过程,以西藏野生二棱大麦和六棱大麦地方品种为亲本构建遗传分离群体,遗传分析发现二棱性状受单个显性基因位点控制.通过集群分离法(Bulked segregant analysis,BSA)分别建立含有22个F2单株的二棱混池和六棱混池,基于SLAF-seq(Specific-locus amplified fragment sequencing)技术共获得456 691个SLAF标签,通过SNP-index和ED两种关联算法交集得到3个与棱数性状相关的侯选区域,总长度为53.84 Mb,包含536个基因,其中能分别被3个数据库GO、KEGG和COG注释的基因有413、189和160个基因.上述研究实现了对控制西藏大麦侧小穗发育性状相关基因的初步定位,结果可为后续目标基因的精细定位和克隆提供理论参考.
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WOS研究方向	Agriculture (provided by Clarivate Analytics)
语种	中文
CSCD记录号	CSCD:6402881
内容类型	期刊论文
源URL	[http://210.75.237.14/handle/351003/30408]
专题	环境治理与食品安全领域_农业生物技术研究
通讯作者	邓光兵
作者单位	1.中国科学院成都生物研究所成都 610041; 2.中国科学院大学北京 100049
推荐引用方式 GB/T 7714	徐珍媚,邓光兵,张海莉,等. 基于BSA分析定位控制西藏大麦侧小穗发育的基因[J]. 应用与环境生物学报,2018,24(6):1350-1358.
APA	徐珍媚.,邓光兵.,张海莉.,梁俊俊.,苏燕.,...&余懋群.(2018).基于BSA分析定位控制西藏大麦侧小穗发育的基因.应用与环境生物学报,24(6),1350-1358.
MLA	徐珍媚,et al."基于BSA分析定位控制西藏大麦侧小穗发育的基因".应用与环境生物学报 24.6(2018):1350-1358.