题名 | 基于适配体检测分析黄曲霉毒素B1新方法的构建和研究 |
作者 | 孙琳琳
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答辩日期 | 2019-06
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文献子类 | 博士
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授予单位 | 中国科学院生态环境研究中心
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授予地点 | 北京
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导师 | 赵强
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关键词 | 黄曲霉毒素B1,核酸适配体,亲和结合,荧光,环境和生物分析
aflatoxin B1, Aptamer, Affinity Binding, Fluorescence, Environmental And Biological Analysis
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学位名称 | 理学博士
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其他题名 | Study and Development of Aptamer Based New Methods for Aflatoxin B1 Detection
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学位专业 | 环境科学
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英文摘要 | 黄曲霉毒素B1(Aflatoxin B1,AFB1)是指由黄曲霉及寄生曲霉产生的次级代谢产物。AFB1是一类毒性极强的真菌毒素,具有严重的致畸、致癌、致突变作用。国际癌症研究机构已经将AFB1列为I类致癌物。AFB1的污染广泛存在于多种农产品的生长,加工,储藏及运输等各个阶段。世界各国每年因AFB1污染而造成的粮食和经济损失十分严重。当人体食用受AFB1污染的食品后,AFB1可直接在人体内产生毒性效应,危害人体健康。因此,AFB1的灵敏检测对保障食品安全、生态环境和人类健康具有十分重要的意义。传统的AFB1检测方法,如高效液相色谱法,薄层色谱法和酶联免疫分析等,存在操作步骤繁琐,样品前处理复杂,或抗体制备困难,稳定性差等不足。核酸适配体是指通过指数富集系统进化技术(systematic evolution of ligand by exponential enrichment,SELEX)筛选得到的,能够与靶分子特异性结合的一段DNA或RNA。与抗体相比,适配体具有可人工合成,稳定性高,易实现功能化修饰与标记,与靶分子结合后,构象改变等特点,在传感分析应用中更具优势。基于以上研究背景,本论文以可识别AFB1的核酸适配体作为亲和配体,系统表征了适配体的亲和性能,并发展了多种简单,快速,灵敏传感分析AFB1的新方法,主要研究内容包括以下几点:
(1)以特定位点四甲基罗丹明(tetramethylrhodamine,TMR)标记的适配体为探针,采用荧光各向异性分析(fluorescence anisotropy,FA)技术系统表征了适配体的亲和性能,测定了适配体的亲和力,考察了适配体的结合位点及适配体对AFB1的选择性。TMR标记的适配体与AFB1结合后,构象发生变化,导致TMR与G碱基之间的相互作用发生变化,引起TMR的局部转动受到影响,因而,适配体探针的荧光各向异性值发生改变。根据适配体探针与AFB1结合前后,荧光各向异性值的变化,我们筛选出当TMR标记在含50个碱基的适配体(A50)的T26位点时,其对AFB1的FA响应更灵敏。当适配体被截短为只含26个碱基(A26)时,其与AFB1仍保持较高的亲和力。A50与A26适配体均为简单的茎环结构,茎环结构的稳定性对适配体与AFB1的结合影响较大。环状部位可能是适配体与AFB1的结合位点。适配体与AFB1,AFB2,AFM1,AFM2,AFG1,AFG2的交叉反应率分别为100%, 61%, 23%, 21%, 6.3%, 6.5%。等温量热滴定分析也证实了适配体的亲和性能。圆二色光谱分析表明适配体与AFB1结合后的构象变化。适配体的亲和性能研究是构建基于适配体的AFB1传感分析方法的基础。
(2)在研究内容(1)的基础上,以TMR标记的适配体为探针,发展了一种直接模式的荧光各向异性分析法,检测AFB1。我们详细考察了影响适配体与AFB1结合的因素,包括MgCl2浓度,pH,温度,缓冲溶液等。实验发现,缓冲溶液中MgCl2对适配体与AFB1的结合十分关键。在优化的实验条件下,实现了对AFB1的灵敏检测。AFB1的检出限是2 nM,检测范围是2 nM~1 μM。适配体对其他几类常见的真菌毒素(赭曲霉素A,赭曲霉素B,玉米赤霉烯酮,伏马毒素B1及伏马毒素B2)无响应。本方法能够实现多种复杂基质(包括稀释的人血清,尿样,啤酒和红酒样品)中AFB1的检测,玉米面粉中AFB1的回收率为82%~117%。本方法在均相溶液中直接检测AFB1,无需分离,操作简单,成本低廉,仅需要荧光染料标记的适配体为探针,在实际样品的分析中具有较大的应用潜力。
(3)发展了一种基于毛细管阵列式荧光扫描分析检测AFB1的方法。在特定位点的T碱基上标记荧光素(fluorescein, FAM)的适配体探针与AFB1结合后,荧光强度显著增加。通过采用毛细管阵列式荧光扫描分析,16个AFB1样品的荧光检测仅需1 min,每个AFB1样品的用量仅需4~5 μL。AFB1的检出限可达0.5 nM。本方法操作简单,检测快速,所需样品量较少,适合AFB1的快速和高通量分析检测。
(4)建立了一种基于适配体的直接模式的表面等离子体共振分析法(surface plasma resonance,SPR),用于AFB1的检测。适配体被固定在传感芯片表面,用于特异性识别AFB1。适配体与AFB1结合后,SPR信号增大,当缓冲液流过芯片表面时,AFB1解离,导致SPR信号下降。SPR分析实验中,适配体与AFB1的反应是快结合和快解离的过程,适配体芯片无需特殊的再生溶液就可以再生。SPR分析表征出了适配体结合AFB1的动力学参数,测定得到适配体与AFB1的解离常数为12 nM。本方法对AFB1的检出限可达0.4 nM,能够实现对稀释的啤酒和红酒样品中AFB1的检测。所发展的SPR方法简单,检测快速,灵敏度高,适配体修饰的SPR芯片稳定性高,可重复利用。
(5)基于AFB1与互补DNA(cDNA)竞争结合适配体,发展了一种MgCl2介导的激光诱导荧光-毛细管电泳(capillary electrophoresis-laser induced fluorescence,CE-LIF)检测AFB1的方法。样品溶液中不含AFB1时,FAM标记的适配体探针与cDNA杂交形成双链DNA。在含有2 mM MgCl2的分离缓冲液中,双链DNA与单链适配体探针可以被CE分离,呈现出两个尖锐的峰。当样品溶液中加入AFB1后,适配体与AFB1结合,导致双链DNA解离。因而,CE图谱中,双链DNA的峰面积下降,单链适配体的峰面积增大。依据探针峰面积的变化,我们实现了对AFB1的定量检测。在实验条件中,cDNA的长度,适配体与cDNA的比例,及样品缓冲液和分离缓冲液中MgCl2的浓度对AFB1的灵敏检测影响较大。在优化的实验条件下,本方法对AFB1的检出限为0.5 nM。这种基于MgCl2介导的CE-LIF分析方法具有简单,快速,灵敏度高,及样品消耗量少等优势。
(6)结合酶反应的信号放大技术,发展了一种基于辣根过氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)联适配体竞争分析AFB1的方法。固定在微孔板表面的BSA-AFB1偶联物与样品溶液中的AFB1竞争结合HRP酶联适配体探针。与BSA-AFB1结合的HRP酶联探针催化底物产生检测信号。随着AFB1的加入,微孔板表面结合的HRP减少,导致信号降低。根据信号的变化可以对AFB1进行检测。当采用HRP酶的生色底物(TMB)时,AFB1的检出限是0.2 nM,检测范围是0.2 nM~200 nM。吸光度分析所需仪器简单,较易实现。当采用化学发光底物时,AFB1的检出限降低到0.01 nM,检测范围扩大到0.01~100 nM。本方法能够实现对稀释的白酒和玉米面粉样品中AFB1的检测,具有实际应用潜力。本方法结合了HRP酶反应的信号放大,检测灵敏度高,适合于AFB1的高通量分析检测。
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语种 | 中文
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页码 | 138
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内容类型 | 学位论文
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源URL | [http://ir.rcees.ac.cn/handle/311016/42286] |
专题 | 生态环境研究中心_环境水质学国家重点实验室
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推荐引用方式 GB/T 7714 |
孙琳琳. 基于适配体检测分析黄曲霉毒素B1新方法的构建和研究[D]. 北京. 中国科学院生态环境研究中心. 2019.
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