题名基于适配体检测分析黄曲霉毒素B1新方法的构建和研究
作者孙琳琳
答辩日期2019-06
文献子类博士
授予单位中国科学院生态环境研究中心
授予地点北京
导师赵强
关键词黄曲霉毒素B1,核酸适配体,亲和结合,荧光,环境和生物分析 aflatoxin B1, Aptamer, Affinity Binding, Fluorescence, Environmental And Biological Analysis
学位名称理学博士
其他题名Study and Development of Aptamer Based New Methods for Aflatoxin B1 Detection
学位专业环境科学
英文摘要

      黄曲霉毒素B1(Aflatoxin B1,AFB1)是指由黄曲霉及寄生曲霉产生的次级代谢产物。AFB1是一类毒性极强的真菌毒素,具有严重的致畸、致癌、致突变作用。国际癌症研究机构已经将AFB1列为I类致癌物。AFB1的污染广泛存在于多种农产品的生长,加工,储藏及运输等各个阶段。世界各国每年因AFB1污染而造成的粮食和经济损失十分严重。当人体食用受AFB1污染的食品后,AFB1可直接在人体内产生毒性效应,危害人体健康。因此,AFB1的灵敏检测对保障食品安全、生态环境和人类健康具有十分重要的意义。传统的AFB1检测方法,如高效液相色谱法,薄层色谱法和酶联免疫分析等,存在操作步骤繁琐,样品前处理复杂,或抗体制备困难,稳定性差等不足。核酸适配体是指通过指数富集系统进化技术(systematic evolution of ligand by exponential enrichment,SELEX)筛选得到的,能够与靶分子特异性结合的一段DNA或RNA。与抗体相比,适配体具有可人工合成,稳定性高,易实现功能化修饰与标记,与靶分子结合后,构象改变等特点,在传感分析应用中更具优势。基于以上研究背景,本论文以可识别AFB1的核酸适配体作为亲和配体,系统表征了适配体的亲和性能,并发展了多种简单,快速,灵敏传感分析AFB1的新方法,主要研究内容包括以下几点:
       (1)以特定位点四甲基罗丹明(tetramethylrhodamine,TMR)标记的适配体为探针,采用荧光各向异性分析(fluorescence anisotropy,FA)技术系统表征了适配体的亲和性能,测定了适配体的亲和力,考察了适配体的结合位点及适配体对AFB1的选择性。TMR标记的适配体与AFB1结合后,构象发生变化,导致TMR与G碱基之间的相互作用发生变化,引起TMR的局部转动受到影响,因而,适配体探针的荧光各向异性值发生改变。根据适配体探针与AFB1结合前后,荧光各向异性值的变化,我们筛选出当TMR标记在含50个碱基的适配体(A50)的T26位点时,其对AFB1的FA响应更灵敏。当适配体被截短为只含26个碱基(A26)时,其与AFB1仍保持较高的亲和力。A50与A26适配体均为简单的茎环结构,茎环结构的稳定性对适配体与AFB1的结合影响较大。环状部位可能是适配体与AFB1的结合位点。适配体与AFB1,AFB2,AFM1,AFM2,AFG1,AFG2的交叉反应率分别为100%, 61%, 23%, 21%, 6.3%, 6.5%。等温量热滴定分析也证实了适配体的亲和性能。圆二色光谱分析表明适配体与AFB1结合后的构象变化。适配体的亲和性能研究是构建基于适配体的AFB1传感分析方法的基础。
      (2)在研究内容(1)的基础上,以TMR标记的适配体为探针,发展了一种直接模式的荧光各向异性分析法,检测AFB1。我们详细考察了影响适配体与AFB1结合的因素,包括MgCl2浓度,pH,温度,缓冲溶液等。实验发现,缓冲溶液中MgCl2对适配体与AFB1的结合十分关键。在优化的实验条件下,实现了对AFB1的灵敏检测。AFB1的检出限是2 nM,检测范围是2 nM~1 μM。适配体对其他几类常见的真菌毒素(赭曲霉素A,赭曲霉素B,玉米赤霉烯酮,伏马毒素B1及伏马毒素B2)无响应。本方法能够实现多种复杂基质(包括稀释的人血清,尿样,啤酒和红酒样品)中AFB1的检测,玉米面粉中AFB1的回收率为82%~117%。本方法在均相溶液中直接检测AFB1,无需分离,操作简单,成本低廉,仅需要荧光染料标记的适配体为探针,在实际样品的分析中具有较大的应用潜力。
      (3)发展了一种基于毛细管阵列式荧光扫描分析检测AFB1的方法。在特定位点的T碱基上标记荧光素(fluorescein, FAM)的适配体探针与AFB1结合后,荧光强度显著增加。通过采用毛细管阵列式荧光扫描分析,16个AFB1样品的荧光检测仅需1 min,每个AFB1样品的用量仅需4~5 μL。AFB1的检出限可达0.5 nM。本方法操作简单,检测快速,所需样品量较少,适合AFB1的快速和高通量分析检测。
      (4)建立了一种基于适配体的直接模式的表面等离子体共振分析法(surface plasma resonance,SPR),用于AFB1的检测。适配体被固定在传感芯片表面,用于特异性识别AFB1。适配体与AFB1结合后,SPR信号增大,当缓冲液流过芯片表面时,AFB1解离,导致SPR信号下降。SPR分析实验中,适配体与AFB1的反应是快结合和快解离的过程,适配体芯片无需特殊的再生溶液就可以再生。SPR分析表征出了适配体结合AFB1的动力学参数,测定得到适配体与AFB1的解离常数为12 nM。本方法对AFB1的检出限可达0.4 nM,能够实现对稀释的啤酒和红酒样品中AFB1的检测。所发展的SPR方法简单,检测快速,灵敏度高,适配体修饰的SPR芯片稳定性高,可重复利用。
       (5)基于AFB1与互补DNA(cDNA)竞争结合适配体,发展了一种MgCl2介导的激光诱导荧光-毛细管电泳(capillary electrophoresis-laser induced fluorescence,CE-LIF)检测AFB1的方法。样品溶液中不含AFB1时,FAM标记的适配体探针与cDNA杂交形成双链DNA。在含有2 mM MgCl2的分离缓冲液中,双链DNA与单链适配体探针可以被CE分离,呈现出两个尖锐的峰。当样品溶液中加入AFB1后,适配体与AFB1结合,导致双链DNA解离。因而,CE图谱中,双链DNA的峰面积下降,单链适配体的峰面积增大。依据探针峰面积的变化,我们实现了对AFB1的定量检测。在实验条件中,cDNA的长度,适配体与cDNA的比例,及样品缓冲液和分离缓冲液中MgCl2的浓度对AFB1的灵敏检测影响较大。在优化的实验条件下,本方法对AFB1的检出限为0.5 nM。这种基于MgCl2介导的CE-LIF分析方法具有简单,快速,灵敏度高,及样品消耗量少等优势。
      (6)结合酶反应的信号放大技术,发展了一种基于辣根过氧化物酶(horseradish peroxidase,HRP)联适配体竞争分析AFB1的方法。固定在微孔板表面的BSA-AFB1偶联物与样品溶液中的AFB1竞争结合HRP酶联适配体探针。与BSA-AFB1结合的HRP酶联探针催化底物产生检测信号。随着AFB1的加入,微孔板表面结合的HRP减少,导致信号降低。根据信号的变化可以对AFB1进行检测。当采用HRP酶的生色底物(TMB)时,AFB1的检出限是0.2 nM,检测范围是0.2 nM~200 nM。吸光度分析所需仪器简单,较易实现。当采用化学发光底物时,AFB1的检出限降低到0.01 nM,检测范围扩大到0.01~100 nM。本方法能够实现对稀释的白酒和玉米面粉样品中AFB1的检测,具有实际应用潜力。本方法结合了HRP酶反应的信号放大,检测灵敏度高,适合于AFB1的高通量分析检测。
 

语种中文
页码138
内容类型学位论文
源URL[http://ir.rcees.ac.cn/handle/311016/42286]  
专题生态环境研究中心_环境水质学国家重点实验室
推荐引用方式
GB/T 7714
孙琳琳. 基于适配体检测分析黄曲霉毒素B1新方法的构建和研究[D]. 北京. 中国科学院生态环境研究中心. 2019.
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