绵羊TrkA 基因的表达及其SNPs与产羔性状的关联性分析

	绵羊TrkA 基因的表达及其SNPs与产羔性状的关联性分析
	张军霞; 乐祥鹏; 王维民; 王志兰; 张娜娜; 胡瑞雪; 谢云龙; 孙武; 邓颖; 李发弟
刊名	农业生物技术学报
	2016
卷号	24 期号:8 页码:1156-1164
关键词	酪氨酸蛋白激酶受体基因(TrkA) SNPs 产羔数基因表达绵羊
中文摘要	为研究绵羊(Ovis aries)酪氨酸蛋白激酶受体(tyrosine kinase A, TrkA)基因组织表达特征及其 SNPs与产羔性状的关联性,本研究以TrkA基因为研究对象,利用qRT-PCR分析其在湖羊心、肝、脾、肺、肾、瘤胃、十二指肠、背最长肌、脂肪、下丘脑、垂体和卵巢等12种组织中的表达水平,同时采用DNA混合池测序和限制性长度片段多态性(restriction fragment length polymorphism, RFLP)等技术检测TrkA基因在963只有产羔记录湖羊(n=526)和小尾寒羊(n=437)群体中的多态性,及其与产羔性状的关联性。结果表明,TrkA基因在卵巢、肺和肝脏中的表达水平最高,在心脏中次之,在背最长肌、瘤胃、脂肪、下丘脑、垂体、脾、肾和十二指肠间表达量较低。通过DNA池测序和RFLP分析,在TrkA基因的内含子9和14分别检测到NC_019458.2:g.105281586C>T和NC_019458.2:g.105284246G>C两个突变。在NC_019458.2: g.105281586C>T位点,小尾寒羊和湖羊群体中均检测到3种基因型,分别为CC、CT和TT型,其中CT为优势基因型,C为优势等位基因;在该位点,湖羊群体遗传杂合度(heterozygosity, He)和遗传纯合度(homozygosity, H_o)均为0.50,有效等位基因数(effective allele numbers, N_e)为1.99;小尾寒羊H_e=0.51,H_o= 0.49,N_e=1.95;多态信息含量(polymorphic information content, PIC)均为0.37,且在小尾寒羊群体中偏离了 Hardy-Weinberg平衡状态。在NC_019458.2:g.105284246G>C位点上同样检测到GG、GC和CC三种基因型,其中GC为优势基因型,C为优势等位基因;该位点在湖羊群体He和Ho均为0.50,N_e=2.00;小尾寒羊 H_e=0.49,H_o=0.51,Ne=1.96。PIC均为0.37;χ~2适合性检验结果表明,湖羊群体在该位点显著偏离于Hardy- Weinberg平衡状态。多态位点与绵羊产羔数的关联性分析表明,NC_019458.2:g.105281586C>T与湖羊和小尾寒羊的产羔数显著相关(P<0.05),而NC_019458.2:g.105284246G>C突变位点仅与湖羊的产羔性能显著相关(P<0.05)。本研究结果表明,TrkA基因可作为绵羊产羔性状早期筛选的候选基因,其SNPs可为绵羊繁殖性状分子标记辅助选择提供依据。
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.lzu.edu.cn/handle/262010/186533]
专题	草地农业科技学院_期刊论文
推荐引用方式 GB/T 7714	张军霞,乐祥鹏,王维民,等. 绵羊TrkA 基因的表达及其SNPs与产羔性状的关联性分析[J]. 农业生物技术学报,2016,24(8):1156-1164.
APA	张军霞.,乐祥鹏.,王维民.,王志兰.,张娜娜.,...&李发弟.(2016).绵羊TrkA 基因的表达及其SNPs与产羔性状的关联性分析.农业生物技术学报,24(8),1156-1164.
MLA	张军霞,et al."绵羊TrkA 基因的表达及其SNPs与产羔性状的关联性分析".农业生物技术学报 24.8(2016):1156-1164.