哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析

	哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析
	杨晓燕; 李梅; 张林; 庞莉; 孙青; 蒋细良
刊名	中国生物防治学报
	2015
卷号	31 期号:1 页码:85-95
关键词	哈茨木霉厚垣孢子转录组测序差异表达基因
ISSN号	2095-039X
其他题名	Transcriptome Analysis of Trichoderma harzianum Th-33 in Chlamydospore Formation
英文摘要	应用高通量转录组测序技术对哈茨木霉产厚垣孢子前期和中期两个不同转录本进行测序, 获得12186个unigenes, 平均长度为1483 bp。被注释到GO (gene ontology)数据库的unigenes有6042个。通过与KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes pathway database)数据库比对, 有5151个unigenes被注释到239条KEGG代谢途径中。比较两个样本, 共有差异表达基因(DEG)6329个, 包括3602个上调基因, 2727个下调基因。其中几丁质酶基因16个, 13个上调、3个下调;几丁质合成酶基因4个, 均上调;葡聚糖酶基因21个, 11个上调、10个下调。KEGG富集分析显示, 氨基糖和核苷酸的糖代谢途径涉及的差异表达基因最多, 有23个;其次是淀粉和糖代谢途径, 有14个差异表达基因参与。推测这两条代谢途径以及相关的差异表达基因可能与厚垣孢子形成有关。本研究为深入研究哈茨木霉Th-33厚垣孢子的形成机制奠定了基础。
学科主题	植物保护
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/135769]
专题	植物保护研究所_生物农药研究室
作者单位	中国农业科学院植物保护研究所, 农业部作物有害生物综合治理重点实验室, 北京, 100081
推荐引用方式 GB/T 7714	杨晓燕,李梅,张林,等. 哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析[J]. 中国生物防治学报,2015,31(1):85-95.
APA	杨晓燕,李梅,张林,庞莉,孙青,&蒋细良.(2015).哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析.中国生物防治学报,31(1),85-95.
MLA	杨晓燕,et al."哈茨木霉Th-33厚垣孢子形成过程的转录组变化分析".中国生物防治学报 31.1(2015):85-95.