玉米DCL1基因鉴定及其自然等位变异分析 | |
徐东东; 赵永平; 王建海; 周强; 谢传晓 | |
刊名 | 玉米科学 |
2015 | |
卷号 | 23期号:1页码:17-25 |
关键词 | 玉米 DCL1基因 基因结构 功能域 重测序 自然等位变异 |
ISSN号 | 1005-0906 |
其他题名 | Identification of Maize DCL1 Gene and Analysis of Its’Natural Alleles |
英文摘要 | 根据生物信息学分析,同源性克隆分离玉米DCL1候选基因,鉴定该基因组织与逆境响应等表达特征,并分析其自然等位变异。结果表明,目标候选基因全长7 408 bp,与拟南芥和水稻DCL1基因氨基酸序列高度保守,相似度分别为91%和77%。mRNA定量PCR分析表明,该基因在幼叶和吐丝期雌穗中表达丰度分别是幼茎的75.35倍和16.21倍;高盐、脱水、ABA、低氮、低磷胁迫处理条件下,幼苗中高盐和ABA处理呈下调表达,低氮和低磷处理呈显著上调表达,脱水处理无显著变化。核苷酸与氨基酸序列的保守性、组织与逆境响应差异表达特征均与拟南芥和水稻等相似。87份玉米自交系10×全基因重测序数据分析结果表明,该基因遗传变异丰富,共83个位点存在自然变异,但外显子区域和主要的功能结构域序列相对保守,约2/3的自然变异集中在内含子区域,外显子区域的27个自然变异位点只有8个位点在16个材料存在氨基酸差异。 |
学科主题 | 农作物 |
语种 | 中文 |
内容类型 | 期刊论文 |
源URL | [http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/130223] |
专题 | 作物科学研究所_遗传育种系 |
作者单位 | 中国农业科学院作物科学研究所, 农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程, 北京, 100081 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 徐东东,赵永平,王建海,等. 玉米DCL1基因鉴定及其自然等位变异分析[J]. 玉米科学,2015,23(1):17-25. |
APA | 徐东东,赵永平,王建海,周强,&谢传晓.(2015).玉米DCL1基因鉴定及其自然等位变异分析.玉米科学,23(1),17-25. |
MLA | 徐东东,et al."玉米DCL1基因鉴定及其自然等位变异分析".玉米科学 23.1(2015):17-25. |
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