从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记

	从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记
	朱振东 1; 霍云龙 1; 王晓鸣 1; 黄俊斌 2; 武小菲 1
刊名	科学通报
	2004
卷号	49 期号:17 页码:1749-1754
关键词	表达序列标签 SSR标记大豆疫霉菌大豆
ISSN号	0023-074X
英文摘要	通过对5800条大豆疫霉菌EST进行电子查询,在369条EST中发现415个SSR.在筛选的EST序列中SSR平均密度为每8.9kb含有1个SSR.在鉴定的SSR中,三核苷酸重复基元的SSR类型最多,占鉴定总数的50.1%,四核苷酸重复基元的SSR类型最少,为8.2%.设计40个SSR引物对对5个大豆疫霉菌菌株基因组DNA进行PCR扩增,有33个引物对扩增出SSR特征条带,其中有28个引物对扩增出在预期片段大小范围之内的条带.在33个功能性引物对中,有15个引物对在5个大豆疫霉菌菌株间扩增出多态性,多态性引物对占45.5%.基于SSR标记进行聚类分析,可将5个检测大豆疫霉菌菌株划分为不同的3个组.本研究建立了大豆疫霉菌的SSR标记,为大豆疫霉菌及相关属种的鉴定、遗传变异、分子作图等研究提供了一种更加有效的分子标记系统.
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/131792]
专题	作物科学研究所_种质资源保存与研究中心
作者单位	1.中国农业科学院作物品种资源研究所, 北京, 100081; 2.华中农业大学植物保护系, 武汉, 430070
推荐引用方式 GB/T 7714	朱振东,霍云龙,王晓鸣,等. 从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记[J]. 科学通报,2004,49(17):1749-1754.
APA	朱振东,霍云龙,王晓鸣,黄俊斌,&武小菲.(2004).从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记.科学通报,49(17),1749-1754.
MLA	朱振东,et al."从大豆疫霉菌ESTs中发掘SSR标记".科学通报 49.17(2004):1749-1754.