利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性

	利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性
	张立娜; 曹桂兰; 韩龙植
刊名	中国农业科学
	2012
卷号	45 期号:3 页码:405-413
关键词	粳稻地方品种遗传多样性遗传结构
ISSN号	0578-1752
其他题名	Analysis of Genetic Diversity of Japonica Rice Landrace in China with Microsatellite Marker
英文摘要	【目的】通过中国粳稻地方品种的遗传多样性分析,阐明各省份粳稻地方品种的遗传结构及其亲缘关系,为中国粳稻杂交育种的亲本选配提供科学依据。【方法】利用43对SSR多态性标记,对原产于中国17个省(市、自治区)的187份粳稻地方品种进行等位基因多样性、遗传结构和聚类分析。【结果】共检测到等位基因351个,每个位点等位基因变幅为2—21,平均每个位点等位基因数为8.2;基因多样性指数变异范围为0.117—0.908,平均为0.550;多态信息含量(PIC)变异范围为0.114—0.902,平均为0.523。在RM72、RM241、RM219、RM412和RM232等位点所检测到的遗传多样性参数值较大。西南、华南、华中粳稻地方品种的遗传多样性明显高于华北和东北地区;云南省粳稻地方品种遗传多样性最丰富,天津和吉林的粳稻地方品种的遗传多样性相对较低。基于Nei’s遗传距离的系统聚类把供试材料分为8个小类群,南方粳稻地方品种主要聚类于第ⅰ、ⅱ、ⅲ、ⅳ和ⅴ等5个小类群,北方粳稻地方品种主要聚类于第ⅵ、ⅶ和ⅷ等3个小类群。基于模型的群体结构分析,供试材料被分为11个亚群,有144份材料被分到相应的11个亚群,其余43份材料被分到混合亚群。【结论】南方稻区粳稻地方品种的遗传多样性明显高于北方稻区,其中西南稻区的粳稻地方品种遗传多样性最为丰富,而云南是粳稻地方品种遗传多样性最丰富的省份。北方与南方粳稻地方品种间存在较大的遗传差异,粳稻地方品种间亲缘关系与地域性存在一定的相关性,这种相关性在北方粳稻地方品种中更为突出。RM72、RM241、RM219、RM412和RM232适合应用于粳稻地方品种的遗传多样性检测。
学科主题	农作物
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/128407]
专题	作物科学研究所_种质资源保存与研究中心
作者单位	中国农业科学院作物科学研究所, 农业部作物种质资源利用重点开放实验室;;国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程, 北京, 100081
推荐引用方式 GB/T 7714	张立娜,曹桂兰,韩龙植. 利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性[J]. 中国农业科学,2012,45(3):405-413.
APA	张立娜,曹桂兰,&韩龙植.(2012).利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性.中国农业科学,45(3),405-413.
MLA	张立娜,et al."利用SSR标记揭示中国粳稻地方品种遗传多样性".中国农业科学 45.3(2012):405-413.