普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析

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	普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析
	陈明丽 1; 王兰芬 1; 武晶 1; 张晓艳 2; 杨广东 3; 王述民 1
刊名	作物学报
	2014
卷号	40 期号:5 页码:924-933
关键词	普通菜豆豇豆属 SSR 标记通用性
ISSN号	0496-3490
其他题名	Development of Genomic SSR Markers in Common Bean and Their Transferability in Cowpea and Adzuki Bean
英文摘要	分子标记具种属间通用性可提高其利用效率, 并降低标记开发成本。本研究基于Roche 454超高通量测序技术获得普通菜豆基因组测序结果, 共开发了560个普通菜豆基因组SSR 标记。利用2份普通菜豆品种对标记进行初步筛选, 有421个标记能够有效扩增。用新开发的标记分析16份豇豆和16份小豆的通用性。结果显示, 185个普通菜豆基因组SSR 标记在豇豆中能有效扩增, 通用性比率为43.9%; 161个SSR 标记在小豆中能有效扩增, 通用性比率为38.2%;在豇豆和小豆中都能获得有效扩增条带的标记共138个; 并且普通菜豆基因序列SSR 标记在豇豆和小豆中的通用性比率高于基因间序列SSR 标记。通用性标记的多态性分析表明, 豇豆和小豆的多态性比率分别为34.0%和24.8%; 且豇豆和小豆中基因间标记的多态性都比基因内标记的多态性高。上述通用性标记为豇豆属作物的多样性评价、连锁图谱的构建及基因定位等方面的研究提供了便利。
学科主题	园艺
语种	中文
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.nais.net.cn/handle/2HMLN22E/128813]
专题	作物科学研究所
作者单位	1.中国农业科学院作物科学研究所, 北京, 100081; 2.青岛市农业科学研究院蔬菜所, 山东, 青岛, 266100; 3.黑龙江省农业科学院克山分院, 黑龙江, 克山, 161606
推荐引用方式 GB/T 7714	陈明丽,王兰芬,武晶,等. 普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析[J]. 作物学报,2014,40(5):924-933.
APA	陈明丽,王兰芬,武晶,张晓艳,杨广东,&王述民.(2014).普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析.作物学报,40(5),924-933.
MLA	陈明丽,et al."普通菜豆基因组SSR 标记开发及在豇豆和小豆中的通用性分析".作物学报 40.5(2014):924-933.