| 题名 | 基于Hadoop的大规模DNA进化树构建算法; Ultra-large phylogenetic tree construction based on Hadoop |
| 作者 | 毛耀宗 |
| 答辩日期 | 2016-03-16 ; 2015-05-18 |
| 导师 | 吴梅红 |
| 关键词 | 进化树构建 基因序多列比 大规模数据 Phylogenetic tree construction Multiple sequence alignment Large-scale Datasets |
| 英文摘要 | 进化树(phylogenetictree)是用于描述基因或者物种之间进化关系的树型拓扑结构，又称为系统发生树。进化树的构建是根据基因序列信息推断物种的衍变史，这有助于了解物种的进化规律和进化机制，进而让人们了解基因功能、疾病关系以及生物进化规律。近年来，进化树的构建研究已经成为生物信息学领域重要课题之一。随着序列数目的日益增加，海量的数据对进化树的构建成本提出了严峻的挑战，亟需能够处理大规模数据的构建方法。本文探讨了有关进化树构建的几个方法，针对大规模建树存在时间代价过高的问题，提出了利用Hadoop并行计算框架构建大规模进化树的新方法，主要完成的工作为： 本文介绍了几种主流的大数据处理平台...; Phylogenetic tree is a tree topology structure used to reveal the evolutionary relationships between genes or species. The purpose of constructing the phylogenetic tree is to infer the developing history of species. It helps us to understand rules of evolution , mechanism of species, and disease relationship . In recent years, the research of constructing phylogenetic tree has become one of the mo...; 学位：工学硕士; 院系专业：信息科学与技术学院_计算机应用技术; 学号：23020121152938 |
| 语种 | zh_CN |
| 出处 | http://210.34.4.13:8080/lunwen/detail.asp?serial=49729 |
| 内容类型 | 学位论文 |
| 源URL | [http://dspace.xmu.edu.cn/handle/2288/134768]  |
| 专题 | 信息技术－学位论文 |
| 推荐引用方式 GB/T 7714 | 毛耀宗. 基于Hadoop的大规模DNA进化树构建算法, Ultra-large phylogenetic tree construction based on Hadoop[D]. 2016, 2015. |
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