题名 | 约氏疟原虫转录组的基因结构和亚种间的差异性剪接; Gene structure analysis and differentially splicing between Plasmodium yoelii subspecies |
作者 | 刘建文 |
答辩日期 | 2017-03-23 ; 2016-05-19 |
导师 | 李剑 ; 刘升发 |
关键词 | 疟疾 RNA深度测序 基因表达 单核苷酸多态性 选择性剪接 Malaria RNA-seq Gene expression Single nucleotide polymorphism (SNPs) Alternative splicing |
英文摘要 | 啮齿类动物约氏疟原虫(Plasmodiumyoelii)是研究宿主-寄生虫相互关系和疟原虫病理分子基础的一种重要的动物模型。尽管约氏疟原虫YM虫株的基本基因组信息已被测定,在最近也有许多啮齿类动物疟原虫的RNA-seq序列信息已见报道,但不同疟原虫品系或者亚种之间可能存在基因编码区及mRNA转录结构上的差异。构建多种疟原虫品系和亚种的cDNA文库将有助于我们对疟原虫遗传模式和转录组结构的认识。 本研究,我们用约氏疟原虫NSM虫株有或无MQ药物压力的红内期原虫样本构建了两个cDNA文库并对其进行深度测序,获得转录组序列再与最近公布的YM虫株cDNA序列相比对,以检测编码区单核苷酸多态性(SNP...; The rodent malaria parasite Plasmodium yoelii is an important animal model for studying host-parasite interaction and molecular basis of malaria pathogenesis. Although a draft genome of P. yoelii yoelii YM is available, and RNA sequencing (RNA-seq) data for several rodent malaria species (RMP) were reported recently, variations in coding regions and structure of mRNA transcript are likely present ...; 学位:理学硕士; 院系专业:生命科学学院_动物学; 学号:21620131152479 |
语种 | zh_CN |
出处 | http://210.34.4.13:8080/lunwen/detail.asp?serial=55520 |
内容类型 | 学位论文 |
源URL | [http://dspace.xmu.edu.cn/handle/2288/133645] |
专题 | 生命科学-学位论文 |
推荐引用方式 GB/T 7714 | 刘建文. 约氏疟原虫转录组的基因结构和亚种间的差异性剪接, Gene structure analysis and differentially splicing between Plasmodium yoelii subspecies[D]. 2017, 2016. |
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