微生物基因组注释系统MGAP

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	微生物基因组注释系统MGAP
	禹胄 ; 李涛 ; 蔡涛 ; 赵进东 ; 罗静初
刊名	http://epub.edu.cnki.net/grid2008/brief/detailj.aspx?filename=WSXB200306019&dbname=CJFQ2003
	2012-04-22 ; 2012-04-22
关键词	微生物基因组基因组注释生物信息学蓝细菌数据库
中文摘要	利用生物信息学方法和工具开发了微生物基因组注释系统 (Microbialgenomeannota tionpackage ,MGAP) ,并用于蓝细菌PCC70 0 2的基因组注释。该系统由基因组注释系统和基于Web的用户接口程序两部分组成。基因组注释系统整合多个基因识别、功能预测和序列分析软件 ;以及蛋白质序列数据库、蛋白质资源信息系统和直系同源蛋白质家族数据库等。用户接口程序包括基因组环状图展示、基因和开放读码框在染色体上的分布图 ,以及注释信息检索工具。该系统基于PC微机和Linux操作系统 ,用MySQL作数据库管理系统、用Apache作Web服务器程序 ,用Perl脚本语言编写应用程序接口 ,上述软件均可免费获得。
语种	中文
其他责任者	北京大学生命科学学院北京大学蛋白质工程和植物基因工程重点实验室北京大学生物信息中心 ; 北京大学生命科学学院北京大学蛋白质工程和植物基因工程重点实验室北京大学生物信息中心北京100871 ; 北京100871
内容类型	期刊论文
源URL	[http://ir.calis.edu.cn/hdl/211010/1581]
专题	北京大学
推荐引用方式 GB/T 7714	禹胄,李涛,蔡涛,等. 微生物基因组注释系统MGAP[J]. http://epub.edu.cnki.net/grid2008/brief/detailj.aspx?filename=WSXB200306019&dbname=CJFQ2003,2012, 2012.
APA	禹胄,李涛,蔡涛,赵进东,&罗静初.(2012).微生物基因组注释系统MGAP.http://epub.edu.cnki.net/grid2008/brief/detailj.aspx?filename=WSXB200306019&dbname=CJFQ2003.
MLA	禹胄,et al."微生物基因组注释系统MGAP".http://epub.edu.cnki.net/grid2008/brief/detailj.aspx?filename=WSXB200306019&dbname=CJFQ2003 (2012).